水环真空泵在使用中容易发生结垢的问题，其原因是多方面造成的，为了有效减少结垢问题的发生，需要想办法来控制。通过控制循环水工作温度来达到防止结垢就是一种有效的方法。
　　循环水的水质与运行的温度超过一定的指标，是造成水环真空泵结垢的主要的原因。为此要尽可能的降低水的硬度，控制好循环水的工作温度才可以解决泵结垢的问题。
　　所以在循环冷却水的运行过程中对各台泵的回水温度和回水量进行检测以保证各台泵的正常供水量，以及回水温度是不超过40℃的一个规定。供水量是可以用阀门来控制的，如果回水温度超过规定的话要采取补充低温度冷水或用其他散热降温的办法来降低软化水池内软化水的温度。
　　另外水环真空泵的泵体排水阀门除了可以用正常的排出泵的内积水外还可以在运行的过程中利用泵体运转的水压来定期的冲洗泵内污垢和水造，一方面可以防止污垢积存且另一方面还可防止水渣转化为水垢。